Άνω και Κάτω είναι κοντά, αλλά δεν έχουν τον ίδιο ρόλο
Η επίσημη γεωγραφική τεκμηρίωση περιγράφει το Άνω και το Κάτω Κουφονήσι ως ξεχωριστά νησιά που χωρίζονται από στενό περίπου 200 μέτρων στο πιο στενό σημείο. Το Άνω κατοικείται και αποτελεί την κύρια βάση· το Κάτω δεν έχει μόνιμο πληθυσμό.